iMODS

iMODS e' un toolkit ad oggetti che racchiude funzionalita' avanzate per implementare modelli complessi basati su simulation agents che operano in spazi multidimensionali.

Le simulazioni vengono modellate definendo 'oggetti' che andranno a popolare uno scenario e 'agenti' che modificheranno le posizioni e la forma degli oggetti durante l'evoluzione della simulazione stessa.

L'impiego di agenti diffusori o percolatori consente ad esempio di modellare un fenomeno di microinquinamento locale o di simulare la penetrazione di un fluido in una faglia o ancora di simulare scenari di supporto al disaster recovery.

Simulation agents vengono impiegati per simulare il comportamento collettivo di colonie di microorganismi riconducendolo a semplici set di equazioni che governano gli spostamenti dei singoli.



Le applicazioni spaziano in vari settori che vanno dall'epidemiologia alla scienza dei materiali, passando per la modellazione dei processi comportamentali delle folle o per i meccanismi di formazione dei tessuti biologici.

In biologia iMODS e' stato utilizzato per modellare i meccanismi di formazione vascolare (angiogenesi). Nel campo della neurodiagnostica per immagini di risonanza magnetica, simulation agents basati su tensori di diffusione vengono impiegati per l'analisi delle fibre nervose e per la mappatura delle connessioni fra differenti aree funzionali del cervello. In farmacologia, agenti percolatori sono stati impiegati per modellare i meccanismi di trasporto del farmaco attraverso la membrana cellulare.

iMODS e' basato sull'ambiente di programmazione cross-platform Java ed include un'interfaccia per la librerie OpenGL per la parte grafica e OpenCL per il supporto al calcolo parallelo.

I modelli di calcolo possono generare dati georiferiti mappabili attravero la piattaforma iGEOS o definire biostrutture partendo dalle bioimmagini elaborate dal ns toolkit iMAGINE.